Dalam waktu dekat, manusia telah dikalahkan oleh parasit virus bernama Gastrea. Mereka diasingkan ke wilayah kecil dan hidup dalam keputusasaan, berdampingan dalam teror.
Di dunia ini terjebak dalam kegelapan—
Rentaro, seorang anak laki-laki yang tinggal di dekat Tokyo dan anggota “Keamanan Sipil”—sebuah organisasi yang berspesialisasi dalam memerangi Gastrea—terbiasa melakukan tugas-tugas berbahaya. Rekannya adalah Enju, seorang gadis muda yang dewasa sebelum waktunya. Mereka bertarung berkat kekuatan aneh mereka hingga suatu hari, mereka menerima tugas khusus dari pemerintah. Misi rahasia ini adalah untuk mencegah kehancuran Tokyo…
Berlatar waktu dekat, kisah aksi heroik yang mendebarkan ini… dimulai sekarang!
