Diclonius, homo sapien yang bermutasi yang konon dipilih oleh Tuhan dan pada akhirnya akan menjadi pemusnah umat manusia, memiliki dua tanduk di kepala mereka, dan memiliki “indera keenam” yang memberinya kemampuan telekinetik. Karena kekuatan yang berbahaya ini, mereka telah ditangkap dan diisolasi di laboratorium oleh pemerintah. Lucy, seorang Diclonius muda dan psikotik, berhasil membebaskan diri dari kurungannya dan secara brutal membunuh sebagian besar penjaga di laboratorium, hanya untuk ditembak di kepala saat dia melarikan diri. Dia selamat dan berhasil hanyut ke sebuah pantai, di mana dua remaja bernama Kouta dan Yuka menemukannya. Setelah kehilangan ingatannya, dia dinamai sesuai dengan satu-satunya hal yang bisa dia katakan, “Nyuu,” dan keduanya mengizinkannya untuk tinggal di rumah Kouta. Namun, tampaknya “Lucy” yang jahat itu belum mati…
