Siswa SMA tahun pertama dan ahli ilmu gaib, Nene Yashiro memanggil “Hanako-san dari Toilet” untuk mengabulkan permintaan romantisnya. Ia akhirnya menjadi asisten spiritual Hanako, membantunya menghancurkan makhluk gaib dan mengubah rumor untuk menyeimbangkan dunia roh dan manusia. Sepanjang perjalanan, Nene belajar tentang hubungannya dengan dunia roh dan rahasia gelap mengenai masa lalu Hanako.